相对能量,新本事让生物分子模拟更加快越来越准

怎么样将 氧化还原电势/对行业内部氢电极 调换为 相对能量?

新本领让生物分子模拟更加快越来越准

单单挂念数字运算,忽略各自的单位,则有:

本报讯
美利坚合众国南达科他大学和巴西联邦共和国南马托格罗索州联邦大学的钻研人口利用最初进的模仿本领评估了pH和氧化还原电势,可能说电子传递速率对海洋生物分子的熏陶。其它,随想小编之一Vinícius
Crossiro还动用图形处理器硬件,使所需的乘除管理时间鲜明缩水。最新开垦的艺术在United States物理联合会出版集团所属《化物学期刊》上可以描述。

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上世纪70年份中叶,Computer被设定为“计算显微镜”,以模拟针对生物分子的试验结果。研究人口的主见是,假使总括发生的新闻丰裕足够和可信赖,那么模拟结果将要原子水平上海市总体表现该系统。多年来,钻探职员不停“打磨”模拟结果,使其临近实验条件,但此前生物分子的氧化还原电势平昔无法获得解释。这一度量标准描述了细胞中的电子在身体内转移的铁汉数量。

硅真空下费米能级为-4.8 eV,思量E+E=-4.5, 那么硅的氧化还原电势为-4.5-=0.3
V

上述组织模拟了单肽——细胞色素c中的NAcMP8内部的pH和氧化还原电势。NAcMP8是呼吸链中的一个分子,含有被称作栗褐素的根本氧化还原中央。

参照下图图片 2

试验职员曾经测量检验了pH和氧化还原电势对NAcMP8的影响,但帕萨特iro利用了新的组成总括办法模拟了这一个结果。杂谈笔者之一AdrianRoitberg是AMBE宝马X3软件套件的一块儿开荒者。正是在该软件内,PASSATiro开采了新的成员引力学方法。

figure2, from Nature,10.1038/35104607

ATENZAiro费用了上万个步骤模拟NAcMP8内pH大概氧化还原电势退换发生的影响。实验成功时,Roitberg欣喜地觉察模拟结果可同实验结果比美。

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该类模拟古板上须要开支大批量时刻,就算使用超级Computer也是那般。而西玛iro创立的新议程可在今世GPU上利用,以加速整个经过。

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相关杂谈新闻:DOI: 10.1063/1.5027379

Figure from Semiconductor-based photocatalysts and photoelectrochemical
cells for solar fuel generation: a review. Catalysis Science &
Technology
2015, 5 , 1360-1384

《中华夏族民共和国科学报》 (2018-08-20 第2版 国际)